Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP2P08253 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP2P08253 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP2P08253 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP2P08253 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP2P08253 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP2P08253 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP2P08253 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP2P08253 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP2P08253 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP2P08253 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP2P08253 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP2P08253 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP2P08253 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP2P08253 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP2P08253 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP2P08253 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP2P08253 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP2P08253 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP2P08253 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MMP2P08253 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP2P08253 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP2P08253 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP2P08253 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP2P08253 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP2P08253 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms