Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN1P07384 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN1P07384 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN1P07384 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN1P07384 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN1P07384 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN1P07384 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN1P07384 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms