Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEFLP07196 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEFLP07196 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEFLP07196 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NEFLP07196 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEFLP07196 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEFLP07196 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEFLP07196 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEFLP07196 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEFLP07196 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEFLP07196 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEFLP07196 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEFLP07196 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEFLP07196 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEFLP07196 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEFLP07196 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NEFLP07196 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEFLP07196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEFLP07196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEFLP07196 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEFLP07196 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEFLP07196 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEFLP07196 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEFLP07196 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NEFLP07196 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEFLP07196 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NEFLP07196 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NEFLP07196 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NEFLP07196 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEFLP07196 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NEFLP07196 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEFLP07196 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEFLP07196 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms