Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4AP04350 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4AP04350 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms