Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHEP01854 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHEP01854 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHEP01854 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHEP01854 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHEP01854 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHEP01854 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHEP01854 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHEP01854 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHEP01854 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHEP01854 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHEP01854 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHEP01854 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHEP01854 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHEP01854 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHEP01854 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHEP01854 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHEP01854 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHEP01854 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGHEP01854 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms