Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX58O95786 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX58O95786 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX58O95786 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX58O95786 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX58O95786 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX58O95786 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX58O95786 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX58O95786 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX58O95786 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDX58O95786 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX58O95786 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX58O95786 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX58O95786 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX58O95786 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDX58O95786 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX58O95786 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX58O95786 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX58O95786 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDX58O95786 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDX58O95786 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX58O95786 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX58O95786 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX58O95786 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX58O95786 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDX58O95786 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX58O95786 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX58O95786 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDX58O95786 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDX58O95786 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX58O95786 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX58O95786 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX58O95786 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDX58O95786 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDX58O95786 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDX58O95786 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX58O95786 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX58O95786 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDX58O95786 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDX58O95786 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX58O95786 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms