Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPO95630 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPO95630 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms