Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN4O95460 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN4O95460 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN4O95460 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN4O95460 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN4O95460 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN4O95460 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN4O95460 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN4O95460 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN4O95460 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN4O95460 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN4O95460 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN4O95460 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN4O95460 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN4O95460 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN4O95460 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN4O95460 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MATN4O95460 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MATN4O95460 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN4O95460 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN4O95460 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN4O95460 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN4O95460 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN4O95460 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN4O95460 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN4O95460 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN4O95460 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN4O95460 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms