Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LETM1O95202 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LETM1O95202 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LETM1O95202 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LETM1O95202 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LETM1O95202 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LETM1O95202 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LETM1O95202 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LETM1O95202 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LETM1O95202 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LETM1O95202 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LETM1O95202 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LETM1O95202 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LETM1O95202 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LETM1O95202 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LETM1O95202 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LETM1O95202 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LETM1O95202 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LETM1O95202 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LETM1O95202 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LETM1O95202 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LETM1O95202 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LETM1O95202 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LETM1O95202 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LETM1O95202 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LETM1O95202 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LETM1O95202 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LETM1O95202 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LETM1O95202 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LETM1O95202 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LETM1O95202 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LETM1O95202 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LETM1O95202 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms