Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX2-2O95096 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-2O95096 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms