Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB3O75712 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB3O75712 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB3O75712 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB3O75712 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB3O75712 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB3O75712 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB3O75712 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB3O75712 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB3O75712 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB3O75712 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB3O75712 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB3O75712 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB3O75712 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB3O75712 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB3O75712 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB3O75712 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB3O75712 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB3O75712 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB3O75712 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB3O75712 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB3O75712 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB3O75712 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB3O75712 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms