Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMUO75648 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMUO75648 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMUO75648 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMUO75648 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMUO75648 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMUO75648 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMUO75648 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRMUO75648 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMUO75648 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMUO75648 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMUO75648 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMUO75648 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMUO75648 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMUO75648 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMUO75648 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMUO75648 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMUO75648 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms