Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF21O75509 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF21O75509 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF21O75509 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms