Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC4O75487 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC4O75487 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC4O75487 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC4O75487 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC4O75487 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC4O75487 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC4O75487 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC4O75487 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC4O75487 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC4O75487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC4O75487 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC4O75487 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC4O75487 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC4O75487 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC4O75487 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC4O75487 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC4O75487 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC4O75487 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC4O75487 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC4O75487 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC4O75487 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC4O75487 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC4O75487 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC4O75487 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC4O75487 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC4O75487 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC4O75487 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC4O75487 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms