Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPFIA4O75335 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPFIA4O75335 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms