Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTN2O75298 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN2O75298 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN2O75298 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN2O75298 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN2O75298 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN2O75298 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN2O75298 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN2O75298 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN2O75298 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN2O75298 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTN2O75298 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN2O75298 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN2O75298 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN2O75298 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN2O75298 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN2O75298 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN2O75298 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN2O75298 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN2O75298 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms