Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GADD45BO75293 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GADD45BO75293 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GADD45BO75293 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms