Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB11FIP3O75154 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP3O75154 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAB11FIP3O75154 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms