Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNASEH1O60930 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH1O60930 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms