Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLIN3O60664 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN3O60664 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLIN3O60664 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms