Protein–RNA interactions for Protein: O60343

TBC1D4, TBC1 domain family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D4O60343 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBC1D4O60343 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBC1D4O60343 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBC1D4O60343 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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