Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH6O60337 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARCH6O60337 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MARCH6O60337 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms