Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAK2O60296 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAK2O60296 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK2O60296 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms