Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CREB3O43889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3O43889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3O43889 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CREB3O43889 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3O43889 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3O43889 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CREB3O43889 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CREB3O43889 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3O43889 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3O43889 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3O43889 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3O43889 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3O43889 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3O43889 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3O43889 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3O43889 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3O43889 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3O43889 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3O43889 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3O43889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3O43889 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms