Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9BO43861 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9BO43861 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms