Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP9O43818 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP9O43818 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP9O43818 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP9O43818 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP9O43818 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP9O43818 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP9O43818 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRP9O43818 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP9O43818 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP9O43818 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP9O43818 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP9O43818 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP9O43818 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP9O43818 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP9O43818 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP9O43818 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP9O43818 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP9O43818 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP9O43818 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP9O43818 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP9O43818 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP9O43818 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP9O43818 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP9O43818 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP9O43818 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP9O43818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP9O43818 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP9O43818 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP9O43818 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP9O43818 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP9O43818 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP9O43818 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP9O43818 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP9O43818 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms