Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDT21O43809 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDT21O43809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDT21O43809 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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