Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYNGR2O43760 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYNGR2O43760 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms