Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRC1O43663 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRC1O43663 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRC1O43663 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRC1O43663 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRC1O43663 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRC1O43663 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRC1O43663 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRC1O43663 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRC1O43663 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRC1O43663 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRC1O43663 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRC1O43663 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRC1O43663 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRC1O43663 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRC1O43663 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRC1O43663 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRC1O43663 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRC1O43663 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRC1O43663 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRC1O43663 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRC1O43663 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRC1O43663 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRC1O43663 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRC1O43663 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRC1O43663 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRC1O43663 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRC1O43663 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRC1O43663 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRC1O43663 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRC1O43663 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRC1O43663 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRC1O43663 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRC1O43663 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRC1O43663 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRC1O43663 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRC1O43663 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRC1O43663 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRC1O43663 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRC1O43663 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRC1O43663 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRC1O43663 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms