Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC3O43617 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3O43617 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3O43617 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms