Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A4O43511 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A4O43511 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A4O43511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms