Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1GO43497 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1GO43497 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms