Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROM1O43490 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROM1O43490 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROM1O43490 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROM1O43490 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROM1O43490 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROM1O43490 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROM1O43490 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROM1O43490 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROM1O43490 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROM1O43490 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROM1O43490 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROM1O43490 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROM1O43490 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROM1O43490 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROM1O43490 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROM1O43490 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM1O43490 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM1O43490 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM1O43490 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM1O43490 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM1O43490 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROM1O43490 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROM1O43490 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROM1O43490 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROM1O43490 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROM1O43490 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROM1O43490 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms