Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTIFO43310 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTIFO43310 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTIFO43310 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTIFO43310 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTIFO43310 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTIFO43310 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTIFO43310 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTIFO43310 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTIFO43310 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTIFO43310 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTIFO43310 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTIFO43310 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTIFO43310 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTIFO43310 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTIFO43310 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTIFO43310 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTIFO43310 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTIFO43310 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTIFO43310 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTIFO43310 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTIFO43310 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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