Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRODHO43272 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRODHO43272 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRODHO43272 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRODHO43272 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRODHO43272 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRODHO43272 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRODHO43272 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRODHO43272 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRODHO43272 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRODHO43272 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRODHO43272 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRODHO43272 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRODHO43272 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRODHO43272 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRODHO43272 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRODHO43272 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms