Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD3O43242 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD3O43242 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD3O43242 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms