Protein–RNA interactions for Protein: O15530

PDPK1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPK1O15530 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDPK1O15530 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDPK1O15530 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDPK1O15530 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms