Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-8O15522 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-8O15522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-8O15522 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms