Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA5O15230 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA5O15230 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA5O15230 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms