Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAD9O15198 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD9O15198 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD9O15198 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD9O15198 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD9O15198 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD9O15198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD9O15198 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD9O15198 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms