Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC1BO15143 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARPC1BO15143 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARPC1BO15143 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms