Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF5O14894 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF5O14894 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM4SF5O14894 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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