Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DYNC1I1O14576 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DYNC1I1O14576 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms