Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBFD1O14562 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBFD1O14562 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBFD1O14562 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms