Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHDO14521 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHDO14521 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHDO14521 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHDO14521 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHDO14521 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHDO14521 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHDO14521 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHDO14521 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHDO14521 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHDO14521 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHDO14521 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHDO14521 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHDO14521 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHDO14521 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHDO14521 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHDO14521 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHDO14521 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHDO14521 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHDO14521 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHDO14521 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHDO14521 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHDO14521 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHDO14521 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHDO14521 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHDO14521 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHDO14521 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHDO14521 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHDO14521 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHDO14521 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHDO14521 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHDO14521 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms