Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F3O00716 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F3O00716 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F3O00716 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F3O00716 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F3O00716 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F3O00716 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F3O00716 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F3O00716 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F3O00716 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F3O00716 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E2F3O00716 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F3O00716 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F3O00716 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2F3O00716 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F3O00716 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F3O00716 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F3O00716 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F3O00716 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F3O00716 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F3O00716 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F3O00716 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F3O00716 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F3O00716 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F3O00716 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F3O00716 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms