Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX7O00628 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX7O00628 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX7O00628 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX7O00628 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX7O00628 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX7O00628 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX7O00628 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PEX7O00628 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PEX7O00628 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX7O00628 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX7O00628 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PEX7O00628 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PEX7O00628 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PEX7O00628 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms