Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEIS1O00470 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEIS1O00470 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS1O00470 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms