Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPH6UMI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GABARAPH6UMI1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABARAPH6UMI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms