Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BNC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BNC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BNC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BNC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BNC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BNC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms